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1．研究生教育初期階段（1982—1998年）

　　建所初期由于基礎(chǔ)較弱，錯過了80年代初期學位申請的較好時機，經(jīng)歷了一段長期無學位授予權(quán)的坎坷道路。但研究所沒有在原地“等、靠、要”，而是通過努力發(fā)展、壯大自己，立足國家和本所需求培養(yǎng)研究生。一方面通過掛靠兄弟院校、研究所培養(yǎng)研究生，一方面堅持不懈地申報學位授予權(quán)。從1982年開始，研究所分別與中科院南京土壤所和北京師范大學合作培養(yǎng)土壤農(nóng)業(yè)化學和經(jīng)濟地理碩士研究生。到1991年，以老一輩科學家何電源和項國榮研究員為首的導師培養(yǎng)了17名高質(zhì)量的碩士研究生。

　　1991年以后，研究生培養(yǎng)開始了新一輪合作培養(yǎng)途徑。分別與中科院動物所（動物學專業(yè)）、中科院遺傳所（遺傳育種專業(yè)）和有關(guān)高校合作培養(yǎng)研究生。不但進行碩士研究生的培養(yǎng)，還合作培養(yǎng)了研究所的在職博士研究生。到1999年，李達模、陳安國、邢廷銑研究員和年輕的導師又合作培養(yǎng)了9名碩士研究生和5名博士研究生。特別是針對研究所在職科研人員學位層次較低的實際，按需培養(yǎng)的5名博士研究生，對提高研究所科研隊伍水平和競爭力，起了較大的作用。這些畢業(yè)的博士研究生已成為研究所各學科學術(shù)帶頭人和優(yōu)秀的青年科學家。

　　2．研究生教育發(fā)展階段（1999—　  ）

　　在立足國家需求和研究所需要合作培養(yǎng)高質(zhì)量研究生的過程中，還不失時機地、堅持不懈地向國務(wù)院學位委員會申報學位授予權(quán)。通過3次申報后，終于在1998年6月獲得了碩士學位授予單位和生態(tài)學專業(yè)碩士授予點，并于1999年招收了第一批獨立培養(yǎng)的碩士研究生。第一批年輕的碩士研究生導師先后走上了研究生培養(yǎng)崗位，他們是王克林研究員、吳金水研究員、印遇龍研究員、王凱榮研究員、郭聰研究員、李陽生研究員和劉新平研究員；2001年起，譚支良研究員、蘇以榮研究員、王勇副研究員、謝小立副研究員、范明哲研究員等先后成為碩士研究生導師。

　　2003年6月，我所獲得生態(tài)學博士授予權(quán)，并同時新增動物營養(yǎng)與飼料科學碩士授予點。2004年9月招收了第一批博士研究生。王克林研究員、吳金水研究員、印遇龍研究員、王凱榮研究員、譚支良研究員、范明哲研究員成為我所第一批博士研究生導師。

　　目前，研究所有博士研究生導師17名（其中中外合作博士生導師8名），碩士研究生導師9名。他們分別從生態(tài)學專業(yè)7個研究方向培養(yǎng)博士研究生，從生態(tài)學專業(yè)8個研究方向和動物營養(yǎng)與飼料科學專業(yè)2個研究方向培養(yǎng)碩士研究生。每年自主招收博士研究生15名左右，招收碩士研究生25名左右，每年還聯(lián)合培養(yǎng)招收博士研究生5名左右，碩士研究生10名左右。截至2008年10月，已培養(yǎng)畢業(yè)研究生221名（其中聯(lián)合培養(yǎng)62名）；目前有在讀研究生148名，其中博士研究生55名，碩士研究生93名。研究生發(fā)表的科研論文已占全所科研論文總數(shù)的65%以上，在科技創(chuàng)新中發(fā)揮了生力軍的作用。流動人員與在編在崗人員的比例已接近2：1。