合肥工業(yè)大學醫(yī)學工程學院導師:徐峻
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合肥工業(yè)大學醫(yī)學工程學院導師:徐峻 正文
姓名:徐峻
性別:男
民族:漢
出生年月:1958.10
籍貫:安徽
學歷:理學博士
◆ 聯(lián)系方式
Phone:020-39943074
E-mail:xujun9@mail.sysu.edu.cn
地址:中山大學藥學院藥物分子設計研究中心,廣州中山大學城外環(huán)東路132號,郵政編碼510006
徐峻,中山大學藥學院教授,博士生導師、藥物分子設計中心主任、中山大學人類病毒學研究所PI、2010年廣東省引進科研團隊核心成員。
徐峻于1989年畢業(yè)于中國科技大學近代化學系,獲理學博士學位。1990-1993年分別在澳大利亞國立大學(ANU)化學研究院(RSC)、加拿大蒙特利爾麥基爾大學做博士后研究。,從事多維多量子核磁共振理論研究和蛋白質(zhì)NMR結(jié)構(gòu)研究。1993年后,歷任美國TRIPOS分子設計公司資深科學家,BIO-RAD薩特勒波譜學研究所(Sadtler Laboratories) 研究開發(fā)部總監(jiān),德國Boehringer Ingelheim制藥公司藥物設計研究組負責人,美國BioFocusDPI制藥公司藥物設計總監(jiān)。
在美國制藥工業(yè)界從事科研和管理工作近20年之后,于2009年春,歸國任教,創(chuàng)立中山大學藥物分子設計生物超算研究和中心。該研究中心已經(jīng)發(fā)展成具有計算機輔助藥物設計、生物超算、小分子儲備、植物化學、藥物合成、X-射線晶體結(jié)構(gòu)實驗室的原創(chuàng)藥物設計力量。研究中心成立3年來,在研項目13項,包括“重大新藥創(chuàng)制”科技重大專項、廣東省引進創(chuàng)新科研團隊項目、中山大學重大項目培育和新興、交叉學科項目、國家自然科學基金。2010年以來,該中心的研究團隊在國際核心期刊發(fā)表論文20多篇,申請國內(nèi)外專利和軟件著作權(quán)多項。與美國、澳大利亞、日本、德國、荷蘭著名研究機構(gòu)建立了合作研究關(guān)系。
徐峻專長于圖論算法及其在化學科學、生命科學中的應用。他的基于偏序集論的通用圖同構(gòu)、同態(tài)、最大公用子結(jié)構(gòu)算法GMA是世界上最早的大型關(guān)系式化學結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫之一RS3的搜索引擎,也是分子識別與感知的核心算法。他的模糊圖映射算法是計算機解析蛋白質(zhì)多維核磁共振波譜的核心技術(shù),成為世界知名的分子設計軟件Sybyl的重要模塊(Capri)。他的基于結(jié)構(gòu)的簇分析算法SCA、類藥指數(shù)DLI方法在JMC和JCICS雜志上發(fā)表后,被業(yè)界廣泛引用,并成為著名分子設計軟件MOE(Chemical Computing Group)的模塊。主要研究方向為:藥物設計、計算化學領域中并行計算算法、圖論算法、海量化學結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫檢索引擎。在藥學領域,研究基于科學原理的中藥解析與創(chuàng)新、從事抗病毒(流感,乙肝)、抗菌素(耐藥菌)、抗代謝類疾病、抗神經(jīng)退行性疾病、抗癌和抗炎藥物的研發(fā)。徐峻教授的團隊包括結(jié)構(gòu)生物學家、藥物化學家、天然產(chǎn)物學家、計算化學家、量子化學家、化學信息學家。與美國、日本、德國、荷蘭、澳大利亞工業(yè)界和學術(shù)界有課題合作。
◆ 個人簡歷
1.1983.09 -1988.09 中國科技大學近代大學化學系 博士研究生
2.1990.04 -1992.10 澳大利亞國立大學高等化學研究院核磁共振中心 博士后
3.1991.10 - 1993.03 加拿大MicGill大學化學系 博士后
4.1993.03 - 1995.08 美國TRIPOS公司 資深研究員
5.1995.08 - 1998.05 美國薩特勒波譜學實驗室 研發(fā)總監(jiān)
6.1998.08 - 2002.02 德國Boehringer Ingelheim制藥北美研發(fā)中心 主管科學家
7.2002.02 - 2007.09 美國DPI制藥 藥物設計與信息學總監(jiān)
8.2008.03 - 至今 中山大學藥學院 教授、博士導師,藥物分子設計研究中心主任
◆ 研究方向
1.藥物設計方法學(化學信息學、生物信息學算法研究、生物云計算、超算)
2.藥物設計應用(先導化合物發(fā)現(xiàn)、優(yōu)化)
3.藥物研發(fā)(抗病毒藥物、抗菌素、抗代謝類藥物、抗炎藥物、抗衰老藥物)
◆ 研究課題
1.新藥創(chuàng)制重大專項:抗甲流新藥臨床前與臨床研究
2.廣東省引進創(chuàng)新科研團隊項目:抗病毒與免疫細胞的再生工程研究
3.中大重大項目培育和新興、交叉學科項目:生物化學代謝通路研究
4.中國-德國-荷蘭國際合作項目:藥物分子物理化學穩(wěn)定性研究
5.國家自然科學基金:降血脂中藥復方的多靶標作用機制研究
◆ 已發(fā)表的代表性論文
1.Jiansong Fang ,Dane Huang,Wenxia Zhao,Hu Ge,Hai-Bin Luo * ,and Jun Xu*,A new protocol for predicting novel GSK-3β ATP competitive inhibitors,J.Chem.Inf.Model.2011,51,1431?1438.
2.Wenxia Zhao,Ling Wang,Hu Ge,Qiong Gu,Jiabo Li*,Jun Xu*,Three-dimensional pharmacophore modeling of liver-1 X receptor agonists,J.Chem.Inf.Model.,2011,published as ASAP paper.
3.Liu,H.,Hu,G.,Peng,Y.,Xiao,P.,and Xu*,J.Molecular Mechanism of Action for Reversible P2Y12 Antagonists,Biophysical Chemistry 155 (2011) 74?81.
4.Yan,A.,Wang,L.,Xu,S.,Xu*,J.Aurora-A Kinase Inhibitor Scaffolds and Binding Modes,Drug Discovery Today,Volume 16,Numbers 5/6,March 2011,260-269.
5.Ge,H,Wang,Y.,Xu*,J.,et.a(chǎn)l.,Anti-flu Agents from TCM,Natural Product Reports,Royal Society of Chemistry,2010,1758-1780.
6.Ding,X.,Jiang,L.,Ke,C.,Yang,Z.,Lei,C.,Cao,K.,Xu,J.,Xu,L.,Yang,X.,Zhang,Y,Huang,P.,Huang,W.,Zhu,X.,He,Z.,Liu,L.,Li,J.,Yuan,J.,Wu,J.,Tang*,X.,Li*,M.Amino acid sequence analysis and identification of mutations under positive selection in hemagglutinin of 2009 influenza A (H1N1) isolates.Virus Genes,August 31,2010,41(3):329-40.
7.Gu,Q.,Xu*,J.; Gu*,L.Selecting Diversified Compounds to Build a Tangible Library for Biological and Biochemical Assays.Molecules 2010,15,5031-5044.
8.Liu,H.,Cui,W.,Xu,J.*,Peng,Y.*,Zhou,J.,and Xiao,P.,Molecular Simulations of the Inhibition of Active Components in Traditional Chinese Medicine on the Thromboxane A2 Receptor,Acta Phys.Chim.Sin.,2010 Vol.26,2549-2556.
9.Liu,H.,Xu*,J.et.a(chǎn)l.,“Targets of Danshen’s Active Components for Activating Blood Circulation Activities”,Acta Phys.Chim.Sin.,2010,26(1),199-205.
10.Xu,J.et al.“Toward Automated Biochemotype Annotation for Commercial Available Compound Libraries”,2006,Molecular Diversity,495-509.
11.Jun Xu,Qiang Zhang,and Chen-Kon Shih,“V-Cluster Algorithm: A New Algorithm for Clustering Molecules Based upon Numeric Data”,J.of Molecular Diversity.,2006,10,463-478.
12.Xu,J.“2D-Structure and Substructure Searching”,Chemoinformatics - From Data to Knowledge,Ed.J.Gasteiger,2003,Wiley-VCH.
13.Xu,J.,“A New Approach to Find Natural Chemical Structure Classes”,J.Medicinal Chemistry,2002,45,5311-5320.
14.Xu,J.a(chǎn)nd Hagler,A.“Chemoinformatics and Drug Discovery”,Molecules,2002,7,566-600.
15.Xu,J.a(chǎn)nd Stevenson,J.,“Drug-Like Index: A New Approach to Measure Drug-Like Compounds and Their Diversity”,J.Chem.Inf.Comput.Sci.,2000,40,1177-1187.
16.Xu,J.,“C-13 NMR Spectral Prediction by Means of Generalized Atom Center Fragment Method”,1997,Molecules,Vol.2,131-145.
17.Xu,J.,“GMA: A Generic Match Algorithm for structural Homorphism,Isomorphism,Maximal Common Substructure Match and Its Applications”,J.Chem.Inf.Comput.Sci.,1996,36,25-34.
18.Xu,J.,“The Use of Fuzzy Graph in Chemical Structure Research”,1998,F(xiàn)uzzy Logic in Chemistry,Academic Press.,Ed.Dennis H.Rouvray,249-281.
19.Xu,J.,Weber,P.L.,Borer,P.N.,“Computer-assisted assignment of peptides with non-standard amino acids”,Journal of Biomolecular NMR,1995,No.5,183-192.
20.Xu,J.,Straus,S.K.a(chǎn)nd Sanctuary,B.C.,“Use of fuzzy mathematics for complete automated assignment of protein 1H 2D NMR spectra”,J.Magn.Res.,Series B.,1994,Vol.103,53-58.
*如果發(fā)現(xiàn)導師信息存在錯誤或者偏差,歡迎隨時與我們聯(lián)系,以便進行更新完善。
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合肥工業(yè)大學
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